En la Europa League disputó 12 partidos y anotó dos goles que ayudaron a su equipo a camiseta arsenal conseguir el título. El Andorra no ganó la liga por una diferencia de 4 goles en el golaverage general. A partir de aquí sus problemas de adaptación hicieron que su rendimiento futbolístico bajara y estuvo cedido una temporada en el Real Madrid, consiguiendo la Liga en 2007, y ese mismo año fue traspasado al Club Atlético de Madrid. En agosto de 2008 el Atlético de Madrid lo cedió al Benfica de Lisboa, con opción de compra. El 22 de agosto de 2013 jugó el XXXV Trofeo Santiago Bernabéu en el feudo madridista frente al Real Madrid.
A pesar de ello, marcó dos tantos frente al Mallorca, que posibilitaron la consecución de la 30ª Liga para el Real Madrid. Tras la consecución del Sevilla de la quinta UEFA Europa League, Reyes se convertía también en el único jugador hasta la fecha de conseguir cinco Europa League: 2 con el At. La temporada siguiente fue la primera que Reyes comenzaba en el Sevilla desde hacía 10 años. Primera División de España 1943/44 11º (23 puntos). Llegó a disputar dos partidos cuando su equipo estaba prácticamente descendido a Segunda División. En la temporada siguiente el equipo andaluz volvió a la Primera División tras salir campeón de Segunda de la mano de Joaquín Caparrós. Primera equipación: Camiseta blanca, pantalón blanco, medias blancas.
Segunda equipación: Camiseta negra con una franja blanca, pantalón naranja, camiseta real madrid niño medias naranjas. Uniforme del 50 Aniversario: Camiseta negra con una franja blanca, pantalón y medias naranjas. Allí, dirigido por Quique Sánchez Flores realizó una buena temporada y consiguió la Copa de la Liga. Copa Latina 1955 tras derrotar al Stade de Reims por 2-0, el que fue también su rival final en la primera Copa de Europa. Fue el jugador más joven en debutar en Primera División con el Sevilla cuando tenía dieciséis años. Ya en la máxima categoría volvió a establecer un récord al ser el jugador más joven de la historia de la Primera División española en marcar un gol. Además de ver partidos de La Liga española (AQUÍ), la Champions League en vivo y la UEFA gratis, puedes ver la NBA Online, Hockey, Baseball, partidos de Tenis y otros muchos deportes internacionales. Finalmente, Bacca anotó el tercero y el Sevilla se proclamó campeón por segundo año consecutivo y Reyes levantó su tercera Europa League.
En los días posteriores al partido, Reyes se disculpó ante el entrenador y públicamente pero, aun así, no fue convocado en el siguiente partido del Atlético de Madrid. El 14 de mayo de 2014 disputó la final ante el Benfica pero fue sustituido en el minuto 78 por Marko Marin cuando el partido iba empate a cero. El 30 de enero de 2012 jugó su centésimo partido, entre las dos etapas, con la camiseta del Sevilla en la derrota por dos a uno ante el Málaga en la vigesimoprimera jornada de Liga. No pudo evitar la derrota de su equipo por dos a uno.
El equipo de San Lorenzo campeón formaba con: Oscar Passet; Rolando Escudero, Oscar Arévalo, Oscar Ruggeri, Damián Manusovich; Roberto Monserrat, Fernando Galetto, Carlos Netto; Paulo Silas; Claudio Biaggio y Esteban González. Fernando Llorente y Cristian Stuani son las otras opciones. Sí, es cierto. El año pasado, si quitamos a Barça y Madrid, cerca andaríamos de las delanteras de Champions. Y el 30 de abril de ese mismo año alcanzó —sumando su trayectoria en el Sevilla y en el Madrid— los 200 partidos en Liga. Fue el jugador que más campeonatos de Liga Europa de la UEFA ha ganado, un total de cinco, dos con el Atlético de Madrid y tres con el Sevilla.