Sin embargo, cuando consiguieron entrar en la zona de ascenso, la suma de dos derrotas consecutivas lo hizo bajar a la 5ª posición, por lo que momentaneamente estaban fuera de la zona de ascenso. En 2005 el Córdoba se encuentra de nuevo en el pozo de Segunda B. A pesar de grandes fichajes como Javi Moreno, el conjunto entrenado primero por Quique Hernández, y luego por José Escalante, terminó 6º en Liga, lo cual no le permitía disputar la promoción de ascenso.
