Contra todo pronóstico el Valencia conisguió una agónica victoria gracias a un gran gol de cabeza del noruego John Carew que batió a David Seaman y clasificó al Valencia. Con el club ya en manos del máximo accionista y presidente, Juan Soler, se incorporan al equipo, gracias al trabajo del director deportivo Javier Subirats, futbolistas como David Villa, Patrick Kluivert, Miguel Brito o Edu. Tras un inicio dubitativo, el equipo logró centrarse en su único objetivo y consiguió quedar 3º, con Villa como goleador destacado con 25 goles. Una de las primeras decisiones del entrenador fue apartar del equipo a tres futbolistas: David Albelda, Santiago Cañizares y Miguel Ángel Angulo.
En octubre, tras la jornada 9, Juan Bautista Soler destituye a Quique Sánchez Flores por una mala racha de juego y algunos resultados negativos en Liga y Liga de Campeones. Las dos temporadas de Héctor Cúper en el club valenciano se saldaron con dos subcampeonatos conseguidos de manera consecutiva en 2000 y 2001 en la Liga de Campeones que nuevamente devolvían al club al panorama internacional. Para paliar la grave crisis del club se anuncia que se seguirá un plan de viabilidad y la deuda se cifra en 547 millones de euros. En la misma rueda de prensa asegura tener 500 millones de euros para acabar con la deuda del club, pero en ningún momento hace efectiva la compra de las acciones.
Tras su destitución, Villalonga ofreció a Soler 76,7 millones de euros por sus acciones, oferta que no aceptó. El 21 de agosto finaliza la primera fase de la ampliación con un importe recaudado de 18.750.000 euros de los 92 millones que en los que estaba aprobada la ampliación. La primera del Bayern Múnich-Real Madrid, camiseta entrenamiento real madrid semifinal de la Champions. En lo deportivo, Unai Emery afronta sin nuevas incorporaciones la Supercopa de España frente el Real Madrid, campeón de Liga. La final se disputó el 23 de mayo de 2001 en el estadio Giuseppe Meazza de Milán, también conocido como «San Siro», frente al poderoso Bayern de Múnich.
Pasan los días y la empresa uruguaya no hace frente a los pagos de los paquetes accionariales de los máximos accionistas: Juan Soler, Vicente Soriano y Vicente Silla. Fue uno de los días más tristes del valencianismo. En el último partido de la temporada, el veterano lateral izquierdo Amedeo Carboni se despidió de Mestalla entre aplausos al retirarse tras 9 temporadas en el Valencia, a la edad de 41 años, 1 mes y 10 días. Las semifinales se jugaron ante el FC Barcelona, que llegó a Mestalla atemorizado pues el conjunto valenciano, y en especial el delantero argentino Claudio López, se había convertido en su bestia negra.
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